疫苗本身质量问题。有的疫苗在生产中由于减毒不够或纯度差，含有某些异性蛋白，注射后多引起过敏反应。
猪健康状况问题。过瘦、有慢性病或有病但尚在潜伏期的猪，注射疫苗后易发生强烈反应。因此，免疫前要检查猪的健康状况，体质状况较差的猪不能注射。
抗体特异性问题。一般一种疫苗只能预防一种病，没有“万能针”。如猪瘟疫苗只能预防猪瘟，对猪丹毒、猪肺疫等则完全无效。
疫苗生效时间问题。疫苗注射后，不是马上就产生免疫力，而是需要一定的时间。如猪瘟疫苗注射后第四天产生免疫力。在疫苗产生免疫力以前猪仍会得病。
免疫期限问题。猪瘟疫苗免疫期为一年，猪丹毒、猪肺疫菌苗的免疫期为半年。超过免疫期应补针，不然猪仍会发病。
工作失误问题。免疫技术不熟练，用量不准确，疫苗因保管不善而失效，或免疫前检查不严等，都可能造成免疫失败。
